臺灣史屬于地方史，臺灣史研究屬于專門史研究。福建學者在臺灣史研究方面已有《臺灣文學史》《荷據時代臺灣史》《臺灣基督教史》《臺灣歷史綱要》等多項成績。臺灣史還有許多“部分之真相”尚待“深入其中”去研究：明鄭時期臺灣史、臺灣移民開發史、中國制度史上的臺灣、臺灣民間宗教史、日據時期臺灣史、臺灣黨外運動史、臺灣政治案件史、臺灣經濟建設史、臺灣教育史等。各項研究又可細分，如中國制度史上的臺灣乃包括了中國鄉約、科舉、教育、職官、幕府、貨幣等制度史上的臺灣。

近年來，福建各高校、各社會科學研究機構新一代學人成長勢頭強健，已具備分工合作、全面開展臺灣史研究的學術實力。

“孔子作春秋而亂臣賊子懼?！睔v史是無情的，歷史反映的是“各部分之真相”和“全部分之真相”。揆之犯罪事實，凡是主張“臺獨”、破壞兩岸關系、阻礙祖國統一進程之人，歷史會把他們一一系于恥辱柱上。